San Rafael (navn i Spansk av erkeengelen Raphael]) er navnet på forskjellige byer og regioner, som hovedsakelig ligger på det amerikanske kontinentet.
Argentina
- San Rafael (Mendoza), hovedstad i Mendoza-provinsen
Bolivia
- San Rafael (Bolivia), vanlig i avdeling Santa Cruz
Chile
- San Rafael (Chile), by i provinsen Talca
- Laguna San Rafael nasjonalpark, Nasjonalpark
- San Rafael-lagunen, lagune
Colombia
- San Rafael, vanlig i avdelingen i Antioquia
Costa Rica
- San Rafael, distrikt kantonen Alajuela
- San Rafael, distrikt kantonen Escazú
- San Rafael, distrikt kantonen Esparza
- San Rafael, hovedstadsområdet i kantonen Guatuso
- San Rafael, distrikt kantonen La Unión
- San Rafael, distrikt kantonen Montes de Oca
- San Rafael, hovedstadsdistrikt i kantonen Oreamuno
- San Rafael, distrikt kantonen Poás
- San Rafael, distrikt kantonen Puriscal
- Kanton San Rafael, kantonen i provinsen Heredia
- San Rafael, hovedstadsområdet i kantonen med samme navn
- San Rafael, distrikt kantonen San Ramón
- San Rafael, distrikt kantonen Vázquez de Coronado
- San Rafael Abajo, distrikt kantonen Desamparados
- San Rafael Arriba, distrikt kantonen Desamparados
El Salvador
- San Rafael (Chalatenango), by i avdelingen Chalatenango
- San Rafael Cedros, by i avdelingen Cuscatlán
- San Rafael Obrajuelo, by i departementet La Paz
- San Rafael East, by i departementet San Miguel
Filippinene
- San Rafael (Iloilo), kommune i Iloilo-provinsen
- San Rafael (Bulacan), kommune i Bulacan-provinsen
Guatemala
- San Rafael la Independencia, kommune i avdelingen Huehuetenango
- San Rafael las Flores, kommune i avdelingen Santa Rosa
- San Rafael Petzal, kommune i avdelingen Huehuetenango
- San Rafael Pié de la Cuesta, kommune i avdelingen San Marcos
Honduras
- San Rafael (Honduras), Honduras by i Lempira-avdelingen
Mexico
- San Rafael (Coahuila), by i Coahuila
- San Rafael (Sonora), by i Sonora
- San Rafael (Sinaloa), Meksikansk by i Sinaloa
- San Rafael de las Tortillas, by i Tamaulipas
- San Rafael (Zacatecas), Meksikansk by i Zacatecas
Nicaragua
- San Rafael del Norte, kommune i Jinotega-avdelingen
- San Rafael del Sur, kommune i avdelingen Managua
Paraguay
- San Rafael del Paraná, distrikt i avdelingen Itapúa
Spania
Amerikas forente stater
- San Rafael, byen av California
- San Rafael, byen New Mexico
- San Rafael-fjellene, Fjellkjeden i California
- San Rafael-elven, elven av Utah
- San Rafael-gruppen, fjellgruppe i det vestlige USA
Venezuela
- San Rafael de Onoto, by i Portuguesa
- San Rafael del Piñal, by i Táchira
- San Rafael de Carvajal, by i Trujillo
- San Rafael del Moján, by i Zulia